Predicción de la estructura de las proteínas by Fouad Sabry

Predicción de la estructura de las proteínas-Este capítulo presenta los conceptos fundamentales y la importancia de la predicción de la estructura de las proteínas, sentando las bases para los debates posteriores.

Hélice alfa-Se centra en la hélice alfa, uno de los motivos estructurales más comunes en las proteínas, y su papel en la estabilidad y función general de las proteínas.

Lámina beta-Explora la estructura de la lámina beta, su formación y cómo contribuye a la estructura terciaria y la función biológica de la proteína.

Estructura secundaria de las proteínas-Profundiza en los diversos elementos estructurales secundarios de las proteínas, explicando su influencia en el plegamiento y la estabilidad proteica.

Estructura terciaria de las proteínas-Analiza la disposición tridimensional de los elementos de la estructura secundaria y las fuerzas que estabilizan esta estructura final.

Topología de membrana-Este capítulo abarca la predicción de las estructuras de las proteínas de membrana y sus complejas interacciones con las bicapas lipídicas.

Alineamiento estructural-Introduce las técnicas utilizadas para alinear las estructuras proteicas, esenciales para comparar y contrastar proteínas homólogas.

Bioinformática estructural-Un vistazo a las herramientas y métodos computacionales utilizados en la predicción y el análisis de la estructura proteica.

Estructura proteica-Ofrece una visión general de los diferentes niveles de la estructura proteica y su relación con la función.

Diseño de proteínas-Analiza los principios y métodos detrás del diseño de proteínas con funciones específicas mediante técnicas computacionales.

Proteína reticular-Explora el concepto de modelos reticulares en el plegamiento de proteínas, lo que ayuda a comprender cómo se forman las estructuras proteicas.

Enhebrado (secuencia de proteínas)-Introduce las técnicas de enhebrado utilizadas para predecir las estructuras proteicas basándose en las similitudes de secuencia con estructuras conocidas.

Mapa de contacto de proteínas-Se centra en el uso de mapas de contacto para predecir el plegamiento y las interacciones de proteínas.

Giro (bioquímica)-Analiza la función de los giros en las estructuras proteicas, su formación y su importancia para mantener la estabilidad proteica.

Modelado de homología-Este capítulo explora el proceso de creación de modelos tridimensionales de proteínas basados ​​en la homología de secuencia.

Modelado de bucles-Se centra en las técnicas para modelar las regiones de bucle en las proteínas, que son cruciales para la función y la estabilidad.

Predicción de novo de la estructura proteica-Ofrece una visión detallada de los enfoques utilizados para predecir las estructuras proteicas sin depender de plantillas homólogas.

Dominio proteico-Analiza la naturaleza modular de las proteínas y la importancia de los dominios proteicos en su estructura y función.

Phyre-Un estudio de caso del servidor Phyre, una herramienta ampliamente utilizada para la predicción de la estructura de proteínas, que explica sus aplicaciones y métodos.

Superfamilia de proteínas-Introduce el concepto de superfamilias de proteínas y su importancia en la biología evolutiva y la predicción funcional.

ITASSER-Una explicación detallada de la herramienta ITASSER, un potente método para la predicción de la estructura de proteínas que integra múltiples técnicas.